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これは、機械的な物です。
instead ofは、「~の代わりに」なので、その後に、どんな品詞でも来る可能性があります。
今回は、by carとby trainが対比になっていて、「by trainの代わりにby car」といういみです。英語では、このような機械的な物ほど、節は節→句は句→名詞は名詞、の繋がりの順で整理します。つまり、今回は、副詞句by carとby trainなので、名詞 carとtrainよりも優先的に副詞句の繋がりが出来ています。
従って、
by car instead of train
ではなくて、
by car instead of by train
なのです。
なるほど🤔めちゃくちゃ勉強になりました!回答ありがとうございましたm(_ _)m