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読みにくくて申し訳ないですが、添付した図を参考にしてみて下さい。
ノックアウトは、遺伝子そのものを破壊します。アミノ酸配列を決めているDNA領域に突然変異を導入したり一部を切り出してしまうことで、正常なタンパク質を作れないようにします。
具体的な方法としては、昨年のノーベル賞で取り上げられたCRISPER-Cas9という技術を使ったりします。
ノックダウンは、遺伝子から転写されてできるmRNAを壊したり、mRNAからタンパク質への翻訳を阻害することで、作られるタンパク質の量を減らします。遺伝子は正常なままです。
よく使われるのは、2006年のノーベル賞で取り上げられたRNAi (RNA干渉)という方法です。目的のmRNAに付く短いRNA（siRNAと呼びます）を加えると、くっ付かれたmRNAの分解が促進されるのでmRNAの量が減り、最終的に翻訳されて作られるタンパク質の量も減ります。
ここに上げたのは一例で、他にも色々とノックアウトやノックダウンする方法があります。
さらに細かいメカニズムについては、「RNA干渉」「CRISPR-Cas9」「ゲノム編集」のキーワードで検索されると見つかると思います。
ありがとうございます！
細かくバッチリです！