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(the written message)S (has)V (punctuation and other conventions [to tell the reader "when to pause", and "what to emphasize"]).O
が大まかな骨組みです。
[]内のto tell the reader when to pause, and what to emphasizeがto tellのto不定詞を使って直前の名詞のconventionsを修飾しています。
[]内ではさらに(tell)V (the reader)O(間接目的語) (when to pause, and what to emphasize)O(直接目的語)となっています。
""で囲ったwhen to pauseとwhat to emphasizeはそれぞれ「疑問詞 to 動詞」動詞すべき何々、どこどこ、いついつ……の形です。

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