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刀狩令は民衆の武装解除を命じ、海賊取締令は海賊衆の掌握と海賊活動の取締を命じました。同時に出されたこれら法令により、秀吉は陸上・海上を問わず日本の全領域を武力で掌握することを目指したと考えられています。
海賊衆については、全時代的な特権を失わせ、それまでの曖昧な立場（身分）を豊臣政権か各大名に従属することを迫り、確定させていく意味がありました。
遅くなってしまいすみません。
わざわざ回答してくださりありがとうございます！
とても分かりやすい説明で助かりました！
海賊取締令は単純に倭寇を禁止したと習いがちですが、江戸時代の身分制度の確定に繋がる面を持っています。この点が盲点なのでしょう。