この文は、「The beans ⬜︎ the best coffee」が主語ですよね。
この⬜︎にwere used to produceを入れると、主語がただの文になり、文全体で述語動詞がwereとareの2つでてきて、文として成立しません。
③を入れると「The beans used to produce the best coffee」となり、usedがuse(使う)の過去分詞、to以下が「〜するために」という副詞的用法です。
訳すと「最高のコーヒーを生産するために使われる豆」となり、後の文にもちゃんと続きます。