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(1) My mother hasn't heard the news yet, but she'll be furious <when she does(代動詞=hears) (it)(副詞節)>.
私の母はまだその知らせを聞いていませんが、<それを聞いた時>には激怒するでしょう。
※未来の内容を表す副詞節は✕will 〇現在(完了)形で表す
(2) Bob has been traveling(現在完了進行形) around Asia <since(接続詞) he graduated(過去形) from college last year>.
昨年大学を卒業してから、ボブはずっとアジアを旅しています。(今も旅しています)
※since+過去形 → sinceの前は現在完了・継続 だと判断する → has been traveling
(3) If I climb Mt. Fuji again, I will have climbed(未来完了形・経験) it <50 times>.
もしもう一度富士山に登れば、私は50回富士山に登ったことになるでしょう。
※If I climb Mt. Fuji again から、次に続く文は未来と判断できる + 50 times(50回) → 未来完了形・経験 と判断する
(4) I had been reading(過去完了進行形) <for two hours> <before(接続詞) my train arrived(過去形).
私が乗る電車が到着する前まで私は2時間ずっと本を読んでいた。
※ before my train arrived(過去形) → beforeの前は過去完了形と判断+for two hours → 過去完了進行形・継続 と判断する

現在使っている英文法参考書の『時制』をもう一度最初から、ご自分の目で見て再度確認してください。
問題文とそっくりの例文が使われているはずです。
『文法の知識+実例の英文』がセットになっていることが必要ではないでしょうか?
知識だけで、それを具体的に表す英文が伴わなければ、それは本当の理解とは言えないと思います。

参考にしてください。

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