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ここで言う呼吸は「細胞内で行われる呼吸の化学反応」のことで、体内では組織液を仲立ちとして呼吸で使われる酸素と栄養素が細胞に送られ、呼吸によって生じた二酸化炭素やアンモニアが細胞から組織液に排出される、という意味です。
呼吸の栄養素（呼吸基質）が糖や脂肪の場合は呼吸の化学反応で二酸化炭素と水が生じ、タンパク質やアミノ酸の場合は呼吸の化学反応で二酸化炭素と水とアンモニアが生じます。水は細胞内や体内にあっても問題ありませんが、二酸化炭素やアンモニアが細胞内にたまると細胞の働きに悪影響があるため、これらは組織液に排出されさらに体外に排出されます。
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