回答

itやthanの働きは理解していますか?
まず、設問文のままでも「今日は寒いが明日はもっと寒くなるだろう。」と言いたいのは分かります。
このときitは「それ」とか「今日」とか具体的なものでなく、天気などを表現するときの形だけの主語です。
そしてthanは「〜よりも」という意味で、後ろに比較対象が必要になりますが、元の文では比較対象が無い、あるいは省略されています(今日の気温)。
もしit will be colder than tomorrow.としてしまうと、「明日よりももっと寒くなるだろう」という意味不明な文になります。

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