①この形はwheneverを強調した強調構文ですか? → その通りです。
もし強調構文だとしたら強調する前の形は、wherever I'm going という形でしょうか?
→ wherever it is that I'm going - (it is + that) = wherever I'm going となるので、その通りです。
②前置詞のあとは、名詞しか置けないはずなのではないでしょうか? → その通りです。[wherever … going]が名詞節となっています。
【例】My wife and I have been talking about <when(副詞) our daughter should start to study English>[名詞節].
妻と私は、<いつ娘が英語の勉強を始めるべきか>についてずっと話しています。
③way to …:…への道、…に至る道 と考えれば良いと思います。
【例】A kind stranger showed me the [way to] the station. 親切な見知らぬ人が駅[へ行く道]を教えてくれました。
参考にしてください。