✨ ベストアンサー ✨
>What do you mean by that?
>これを、I wonder の後に続けると、
>I wonder what do you mean by that.
>になるのは何故ですか？
そもそもなりません！
I wonder what you mean by that が正しいかと思います。
>疑問詞が主語の場合のみ、疑問形の形をそのまま用いるのではないのですか？
いや、おっしゃる通りですよ！
間接疑問文の場合（文の途中に疑問文を埋め込みたい場合）疑問詞の部分が主語の場合は語順は疑問文をそのまま。
他の場合は、疑問詞の後ろの語順を、肯定文に戻しますよ！だから、I wonder what do you mean by that は文法的には間違いです！
そんな言い方どこかで出てきたんですか？自分が知らない何かのフレーズかと思ってググったけどそれっぽいのはなかったです。
やばいですねその先生。。。
この説明そのまま見せてあげてください。笑
自称進学校に通っているので、そういう先生ばかりです笑
回答ありがとうございます。
学校では、こう習ったのです……。
先生に何故こうなるのかを聞いたところ、「普通にするだけだよ」とだけ言われました笑
doはいらないのですね！
解決してスッキリしました。
本当にありがとうございます！