それは、関係代名詞whatには主格(=主語になる)と目的格(=目的語になる)の二つの働きがあるからです。
【例文】
〇主格の場合:<What(S1) is(V1) important now>(S2) is(V2) [to do it right away](C1).
<今重要なこと>は、[それをすぐにやること]です。
〇目的格の場合:<What(O1) you(S1) did(V1) yesterday>(S2) was(V2) excellent(C2).
<あなたが昨日やったこと>は素晴らしかった。