"been"はbe動詞でよく用いられる「=」のイメージを過去分詞に当てはめ、
「過去の時点での=」を表していると考えると良いかと思います。
現在完了の継続用法になっている時点で
「過去のある時点から現時点までその状況をもっている」という風に、
「ずっと」を表す事になります。
(用法によって捉え方は若干変わります。)
今回の場合は継続なので
一昨日から今まで「彼女は」「過去の時点で起こった[=欠席の状態]」を「(現在までずっと)持っている」
と考えればスムーズかと思います。
参考のひとつにしていただけると幸いです。