to visitです。
(京都には訪れるべき場所がたくさんあります。)
この文ではto不定詞は｢〜するための｣という意味で使われています。前者を入れて直訳すると「京都には訪れるための場所がたくさんあります。」。
後者を入れた場合、itがあって、直訳すると、「京都にはそこに訪れるためのたくさんの場所があります。」となって、そこ(it)が何を指しているのかわかりませんし、 100歩譲ってたくさんの場所 を指しているとしても2重になってしまいますからitは不要です。
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