制限酵素というものは,それぞれの制限酵素特有の認識配列というものを持っています.この認識配列をみつけたら,DNA鎖を切断します.
この問題の制限酵素であれば,5'-GGATCC-3'が認識配列になります.
制限酵素というものは,認識配列があればその配列を無条件で切断します.この問題のDNA断片(図2 左図)には,その認識配列が2か所(E1,E2)存在しているため,2か所とも切断されます.
質問の意図があまり分からなかったので,答えになっているか分かりません.もう少し具体的に質問していただけたら解説します.