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一條mRNA可以編碼一個或多個多肽，這取決於它的長度和具體的轉錄後修飾過程。
在翻譯過程中，一個mRNA分子上的一段序列稱為開放閱讀框（open reading frame，ORF），它通常以AUG起始密碼子（也稱為起始密碼子）開頭，並以終止密碼子（UAA，UAG或UGA）結尾。一個完整的ORF將編碼一個多肽，但在同一mRNA上，也可以有多個ORF。此外，有時候mRNA在翻譯前或翻譯過程中會發生剪接或其他後轉錄修飾，從而產生不同的可翻譯序列（coding sequence，CDS），因此同一mRNA也可以編碼多個不同的多肽。
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