細胞質→細胞膜の内側の部分(細胞壁と核を除く)
細胞小器官→細胞質の中の小器官(ex.核、ミトコンドリア...)
細胞質基質→細胞の中の小器官でない部分
細胞質とは、核を除く細胞膜の内側部分のこと(細胞質基質や一部の細胞小器官も含む)
細胞小器官は、核を含む細胞質の中のにある、形のあるパーツたち(小器官)
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すみません、「細胞質の中にある、」です。
大体こんな感じだったかと思います。