寄進地系荘園の話で良いでしょうか。
「開発領主（土地を開墾した人）」から土地を寄進された貴族や寺社を、「領家」といいます。
「領家」は、「不輸の権」によって、土地の税金が免除になります。
...が、時々、その領家の政治力や、その土地の国司の力関係の問題で、税の免除が受けられないことがありました。
そういう時、領家は、自分より権力を持つ者へと、土地を再寄進しました。
その、再寄進された大貴族を、「本家」といいます。
土地は、税の免除が受けられるまで、何度も再寄進されることがありました。
その場合、同じ土地に、いくつもの領家が存在します。
その領家を束ねるのが本家です。
ちなみに、本家がいない土地もあります。
（最初に寄進された段階で、領家が税の免除を受けられた土地）
そこの持ち主は、領家と呼ばれます。
あくまで、「土地を再寄進された人」が本家と呼ばれるんです。
追記で。
なので、領家から本家になることはありません。