Question

は

ここの解き方がいまいち分かりません。誰か詳しく解説してくれる人いたら教えてください。

続く。
の
Ⅱ 河川や土壌などの環境中には、そこに生息する生物の排出物や遺体, はがれた体表組織
の一部などに由来する多くのDNAが含まれている。 このようなDNAを「環境 DNA」と
いう。現在では,環境DNAに含まれる生物種特有のDNA 領域 (DNA バーコード)を増
幅して網羅的に解析する「環境DNA メタバーコーディング」という手法が開発されている。
これにより、 直接生物を捕獲することなく、その地域に生息する可能性のある生物種をま
とめて把握することができる。
たとえば,ある地域で魚類について環境DNAメタバーコーディングを行う場合には、
いくつかの地点で採水を行い,その中に含まれるDNAを抽出した後、特殊なプライマー
を添加してPCR法を行い、DNA バーコードとなるDNA断片を増幅する。この増幅され
た DNA断片を次世代シーケンサー(多数のDNA 断片の塩基配列を同時に決定すること
とす
ができる装置)にかけ/ 魚類の塩基配列データベースと照合すること
断片がどの種に由来するものかを解析できる (図4)。
それぞれの DNA
目
|ATATTGGACAT
採水
DNAの抽出 増幅
ATTTTGCACAG
ATATTGGACAT
CTGGTGCACAG
CTGGTGCTCAT
CTGGCCCTCAC
ATTTTGCACAG
CTGGTGCACAG
CTGGTGCTCAT
[CTGGCCCTCAC
ATATTGGACAT
ATTTTO
CTGGTGCTCAT
CTGGCCCTCAC
データベース
との照合
CD
[ATTTTCCACAG
図4 環境 DNAメタバーコーディングを模式的に示したもの
-64-

DNA
KAMURA TA
DNA
分子
分子量
マーカー
O
永動開始点→
[
泳動開始点→
8-10)
DNA断片の長さ 100g
泳動方向
D 500
D 500
N
400
N 400
--
300
200
泳動方向
300
200
100
さ100
(bp)
栽培イチゴ 対照
(bp)
栽培イチゴ
対照
P Q R 実験
P Q R
実験
bp は, DNA 断片の長さを示す単位である。
E
'e min'a
図2 PCR法を行った後の電気泳動結果
図3 Ear I 処理後の電気泳動結果
表1 PCR法の反応液
試薬
加える試薬の量
対照実験
8
10倍に濃縮したNH緩衝溶液
2.0μL
2.0μL
MCl 溶液
ヌクレオチド溶液
2.0μL
2.0μL
1.6μL
1.6μL
プライマーを含む溶液
0.4μL 0.4μL
716
栽培イチゴから抽出した
イ
μL
I
AL
no DNA
(10 ng/µL) )
酵素 X を含む溶液
0.2μL
純水
ウ uL
オ
0.2μL
AL
計20μ L
at 20 L
13.0.
2.0+2.0.
2+2+1.6+0.4+2+0.2.
20
812.
=
11.8-
-62-

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