まず、「也」の主要な意味・用法は以下の通りです。
【主要な意味一覧】
①～である。（断定の意味）／読み方→「なり」（ひらがな表記）
②疑問・反語・詠嘆の意味／読み方→「や」（ひらがな表記）
（＋α「何也（何ぞや）」の形もあり。）
③主格の強調／読み方→「や」（ひらがな表記）
④語気を強める役割（置き字で読まない）。
そして識別方法としては、以下のようなものが挙げられます。
・文（特に最初のほう）に「何」「安」「焉」「誰」といった疑問詞が登場している→②
・文中に存在している→③
・「也」の直前の送り仮名が言い切りの形になっている→④
上記以外の場合→①
③④はあまり出ないので、ひとまず①②がしっかりと見分けられればOKです！
ちなみに例文は以下のページにあるので、よかったらご覧になってみて下さい。
漢文の「也（なり・や・置き字）」の意味・例文・識別方法を解説！
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