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在做雜交時,父母本相互交換,這在遺傳學上稱為互交。例如,現有兩個親本,用P1和P2表示。第一個雜交實驗♀P1×P2♂,第二個雜交實驗♂P1×P2♀,即第一個雜交實驗P1為母本,而P2為父本;第二個雜交實驗P1卻作為父本,而P2卻作為母本,前一個雜交組合稱為正交,後一個雜交組合稱為反交,兩個雜交組合就叫互交。互交實驗結果是否一致可以推斷控制性狀的基因是細胞質基因還是細胞核基因。當核基因分為常染色體基因(位於常染色體上的基因)和性染色體基因(位於性染色體上的基因)時,兩種基因控制的性狀也可以通過互交實驗加以區別。互交結果一致說明控制性狀的基因是常染色體基因;不一致說明基因為性染色體基因。

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