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見かけの光合成速度は光合成速度から呼吸速度を引いた値を示しています。光合成では有機物(デンプンなど)を作り、呼吸では逆に消費します。そして、呼吸で消費しきれなかった有機物は植物の体の成長などに使われます。
つまり、見かけの光合成速度が大きいほど、その植物はよく成長できるということになります。異なる植物の成長を比較する時など、見かけの光合成速度で比較して、どちらが早く成長するか〜などを判断する事ができます。
ただ、これはあくまで理論値で実際の自然界ではこんなに単純に比較出来ないんですけど…動物による被食なんかも関係してきますし。