✨ ベストアンサー ✨
関係代名詞節内に先行詞相当の名詞はありません。
whichがその役割を果たしているからです。
なので、itは要りません。
このままでも間違いでは無いですが、
それだと前置詞ofの後ろに名詞がなくなり不格好なので
whichの前にofを持ってきて
of whichとした方が良いでしょう。
さらに、only a part ofの形を崩したくないなら
the story only a part of which I have heard
としても良いと思います。